著書，訳書
藤井孝藏「スキーは頭で滑る」，テクノライフ選書，オーム社，(1997). 朝倉書店,( 1996).
藤井孝藏他3名「流れのコンピュータグラフィックス」可視化情報ライブラリー 第５巻
セオドアジョーゲンセン著，生駒俊明，藤井孝藏，生駒孜子共訳「ゴルフを科学する」丸善，(1995).
中橋和博，藤井孝藏「格子形成法とCG」数値流体力学シリーズ6巻，東大出版会，(1994).
藤井孝藏「流体力学のための数値計算法」，東大出版会,，(1994)
編書
Recent Development of Aerodynamic Design Methodologies,
Notes on Numerical FluidMechanics, Vol. 68,
Ed. by K. Fujii and G. S. Dulikravich, Vieweg, (1999).
カラー表現における可視化技術, 谷田好通監修, 富士テクノ出版，(1996).
Supercomputers and Their Performance in CFD, Notes on Numerical Fluid Mechanics,
Vol. 37, Ed. by K. Fujii,Vieweg, (1992).
部分執筆
Kozo
Fujii,Nobuyuki Tsuboi, Nobuyoshi Fujimatsu, Visualization of Jet Flows over
a Plate by Pressure Sensitive Paint Experiments and Comparison with CFD VISUALIZATION AND IMAGING IN TRANSPORT PHENOMENA, Vol.972, pp.265-270,
ANNALS OF
THE NEW YORK ACADEMY OF SCIENCES, Oct.,( 2002).
Kozo
Fujii, Lessons Learned from the blast WaveComputation Using Overset
Moving Grids.-Grid Motion Improves the Resolution-
Innovative Methods for Numerical Solutions of Partial Differential Equations,
World Scientific, Jan,( 2002).
Ed. By.M. M.Hafez,&J.-J. Chattot Workshop held in Arcachon,France,July, 11-13,
(1998). Celebrating 60 yers birthday of prof. Phil Roe.
Kozo Fujii, CFD Applications to Space Transportation Sytems, Frontiers of Computational
Fluid Dynamics 2002,
Ed. by D.A.Caughey and M. M. Hafez , pp,459-472, Jan.,(2002)
藤井孝藏,
「計算力学と社会」の中の「航空宇宙」養賢堂，pp141-145, 平成13年9月（2001）．
Kozo
Fujii, Real-time Computation and
Visualization on Mobile PCﾕs,Computational Fluid Dynamics for the 21st Century,
Ed. by M. Hafez, K. Morinishi and J. Periaux Notes on Numerical Fluid Mechanics,
Vol. 78, Springer,( 2001).
Ed. by D. A. Caughey and M. M. Hafez, World Scientific,
Nov., (1998). Frontiers of Computational Fluid Dynamics ,(1998)
What Have We Learned from CFD Research on Train Aerodynamics
Kozo Fujii and Takanobu Ogawa, Ed. by M.
Hafez and K. Oshima, World Scientific,Nov., (1998).
CFD REVIEW-1998, "Computation of Blast Wave Propagation Using an Overset
Moving Zonal Method", Kozo Fujii and Fumio Shimizu
乱流の数値流体力学?モデルと計算法?「第２章 数値シミュレーション手法の基礎」, 大宮司久明, 三宅裕, 吉沢徴 編, 東京大学出版会,
pp.25-pp.45,( 1998).
自動車開発のシミュレーション技術「第８章 ポストプロセシング」, 藤井孝藏, 藤谷克郎, 間瀬俊明 編集幹事, 自動車技術会編, 朝倉書店,
pp.137-153, (1997).
流体実験ハンドブック（分担執筆）, 笠木伸英他編,( 1997).
カラー表現における可視化技術（分担執筆）, 谷田好通監修, フジテクノシステム出版, (1996).
衝撃波ハンドブック（分担執筆）, 高山和喜編, Sprinter, (1995).
Solution Techniques for Large-Scale CFD Problems, "Performance of a Japanese
Vector-Parallel Supercomputers on Large-Scale CFD Problems",Computational Methods
in Applied Sciences, Ed. by W. G. Habashi, pp.123-137, Feb.,( 1995).
Supercomputers and Their Performance in Computational Fluid Dynamics, "NAVIER-STOKES
BENCHMARK TESTS"
by Kozo Fujii and Hideo Yoshihara Ed. by Kozo Fujii, Vol.37, pp.105-126, Vieweg,
(1993).
数値流体力学 基礎と応用, 「コンピュータグラフィックスの利用」pp. 197-212,
数値流体力学 基礎と応用, 「CFD実用化のための一方法とその応用」pp. 400-403, 保原 充, 大宮寺久明 編集, 東京大学出版会, (1992).
High Performance Computing Research and Practice in Japan, "Activities
of Computational Fluid Dynamics in Japan:
Compressible Flow Simulations",Kozo Fujii, Hiroshi Endo and Michiru Yasuhara,
pp.139-161, John Wiley and Sons, (1990),
Visualization in Supercomputing, "Supercomputers and Graphic Workstations
in Fluid Dynamics Research",
Kozo Fujii, pp. 3-14, Springer-Verlag, (1990).
Computational
Methods in Viscous Aerodynamics, "Navier-Stokes Code Development for Transonic
Flow Simulations"
Hideo Nagasu and Kozo Fujii, pp. 273-300, Elsevier, (1990).
Ｒ＆Ｄ コンピューティング要覧「計算流体力学による航空機設計」, pp. 383-389.
Ｒ＆Ｄ コンピューティング要覧「NASA Ames研究所のNASシステムとその利用」 , pp. 527-530, サイエンスフォーラム社刊, 昭和63年3月.
雑誌等
美しさが価値をよぶ, 藤井孝藏, 日経サイエンス, 第29巻第2号, 日本経済新聞社, 2月,( 1999).
自動車とその世界，No. 270, (1997)
物理法則をシミュレーションして可視化する, 対談（藤井孝藏，廣瀬通孝）
ボールはなぜ曲がる？, 藤井孝藏, パリティ9巻5号, 丸善, 5月,( 1994).
研究開発マネジメント,９月号,（株）アーバンプロデュース,３月, (1994).
研究開発におけるCG?現状と今後の展望?, 藤井孝藏
流体解析のためのビジュアライゼーション, 藤井孝藏, ＰＩＸＥＬ,１月,(1991).
田村善昭 藤井孝藏, ＰＩＸＥＬ,１２月,( 1989).
流体力学におけるサイエンティフィック・ビジュアライゼーション
スーパーコンピュータとグラフィックワークステーションー流体解析における最近の利用ー, 藤井孝蔵, ＰＩＸＥＬ,１月,( 1989).
脚光をあびる計算流体力学の実用化, 藤井孝藏，トリガー, 5月号, (1985).